Ketua KPU Kota Yogyakarta, Nasrullah, SH., S.Ag., MCL., memberikan arahan dalam Rapat Pleno Rekapitulasi Hasil Penghitungan Perolehan Suara Pemilu Presiden dan Wakil Presiden Tingkat Kota Yogyakarta Tahun 2009 yang dilakanakan di Pendopo Balaikota Yogyakarta, pada Tanggal 16 Juli 2009, tampak terdapat kotak suara berasalah dari rekapitulasi hasil pemilihan umum dari tingkat Kecamatan.